On peut définir un modèle comme étant une représentation simplifiée d'une réalité complexe.
Au terme "modèle" on associe le vocable "système" qui représente la réalité qu'on se propose de modéliser.
Un système peut avoir plusieurs sous-systèmes et composantes qui ont des interconnexions et qui correspondent aux différents niveaux d'étude.
En agronomie, le système est représenté par le complexe "climat-sol-plante" dont le comportement est modifié par les techniques culturales appliquées.
La bioinformatique fournit des bases de données centrales, accessibles mondialement, qui permettent aux scientifiques de présenter, rechercher et analyser de l'information.
Elle propose des logiciels d'analyse de données pour les études de données et les comparaisons et fournit des outils pour la modélisation, la visualisation, l'exploration et l'interprétation des données", selon une définition de l'Institut Suisse de Bioinformatique