• Intitulé du Master : Protection des végétaux
  • Semestre : semestre 3
  • Intitulé de l’UE :
  • Intitulé de la matière : Bioinformatique et modélisation
  • Crédits : 4
  • Coefficients : 2

Ce cours destiné aux étudiants de M2 en protection des végétaux se divise en deux parties distinctes. La première partie, intitulée "Modélisation", permet à l'étudiant de se familiariser avec les concepts de base liés à la modélisation : son importance, ses objectifs, sa classification et les étapes de l'élaboration d'un modèle. À la fin de cette première partie, un ou plusieurs exemples de modèles mécanistes seront étudiés afin de mettre en pratique les connaissances acquises dans les chapitres précédents.

La deuxième partie du cours aborde la bioinformatique. Elle commence par un bref rappel des notions de base relatives aux molécules biologiques, notamment les acides nucléiques et les protéines, ainsi que des aspects informatiques tels que les sites web, les réseaux et les serveurs. Ensuite, les concepts fondamentaux des bases de données biologiques et des outils de bioinformatique disponibles en ligne seront exposés. Enfin, des travaux pratiques seront programmés pour permettre aux étudiants d'exploiter leurs connaissances théoriques dans l'exploration des bases de données et l'utilisation des logiciels de bioinformatique en ligne.

 BIOLOGIE MOLECULAIRE

Le module « Génie génétique et biotechnologie » vise à initier les étudiants aux principes et techniques de manipulation du matériel génétique, appliqués au domaine de l’agriculture. Il met l’accent sur les biotechnologies végétales utilisées pour améliorer les espèces cultivées : création de plantes résistantes aux maladies, tolérantes aux stress abiotiques (sécheresse, salinité…), enrichies en nutriments, ou encore adaptées aux changements climatiques.

Les étudiants découvriront les principales techniques du génie génétique telles que la PCR, le clonage moléculaire, l’utilisation de vecteurs, les enzymes de restriction, la transformation génétique, ainsi que les méthodes d’identification et d’expression des gènes. Le module aborde également les différentes formes de biotechnologies agricoles (OGM, culture in vitro, sélection assistée par marqueurs…) et les enjeux éthiques, économiques et environnementaux qui y sont liés.

Ce module prépare les étudiants à comprendre les innovations biotechnologiques modernes et à les appliquer dans un contexte de développement durable de l’agriculture.

     Ce cours fournit aux étudiants différents outils mathématiques pour résoudre des problèmes environnementaux : outils mathématiques, statistiques et optimisation de plans d’expériences et Autonomie du jeune chercheur sur le plan du traitement statistique de ses données de terrain ou/et de laboratoire